感染性疾病科成立于建院之初，2004年正式更名为感染性疾病科，承担传染病的诊疗、疑难感染性疾病的诊治及会诊、职工职业暴露的处置、重大公共卫生事件的处置工作，科室采取平战结合模式，随时准备应对突发公共卫生事件。科室现有医护人员14人（医生4人，护士10人），其中主任医师1人，副主任医师2人，主治医师1人。配备有心电图机、心电监护仪、输液泵、除颤仪、支气管镜、无创呼吸机、有创呼吸机及经鼻高流量氧疗机。设置门诊有：感染性疾病科门诊、结核门诊、肝炎门诊、肝病（非病毒性）门诊、肠道门诊及发热门诊，病房开放床位21张，其中结核病床6张，收治范围：感染性疾病、发热待查、结核病及传染病患者。